转运局在上海，光绪十年设，委苏松太道办之，以理台湾军械、饷项、转运之事。
支应局在台北府治，光绪十一年设，由布政使督办，而台南设分局。
捐输局在台北府治，光绪十一年设，由布政使督办，而台南设分局。
善后局在台北府治，光绪十二年设，由布政使督办，以理战后之事。
招垦局光绪元年设于厦门、汕头、香港，以办闽粤人来台开垦之事。
招商局光绪十二年设于新加坡，以办南洋华侨来台经营之事。
铸钱局在台南府治东安坊，康熙二十四年设，后裁。
官银号同治二年设于沪尾，以收解关税，其后旗后、安平、鸡笼以次开办。
官银局在台北府治，光绪十六年设。
台南官票局在台南府治，光绪二十一年设。
法审局在台北抚署内，光绪十二年设。
官医局在台北考棚内，光绪十二年设，十七年裁。